De højeste muslimske skoler i det arabiske kalifat blev kaldt madrasaher, disse institutioner dukkede først op i det 9. århundrede e. Kr. Den første af dem blev åbnet i 859 i Marokko. Madrasaher arbejdede norm alt ved moskeer, de underviste i arabisk, koranen, islams historie, hadith, sharia (muslimsk etisk kodeks, der danner muslimernes moralske synspunkter), kalam. I middelalderen havde højere muslimske skoler ofte ikke kun teologisk, men også kulturel betydning.
Uddannelse i den islamiske verden
Det arabiske kalifat stammer fra profeten Muhammed, eller rettere sagt, fra det samfund, han skabte i Hijaz'en i begyndelsen af det 7. århundrede. Da muslimerne efter genbosættelsen etablerede sig i Medina, beordrede profeten Muhammed dem at lære deres børn at læse og skrive i moskeer. Efterhånden dukkede separate lokaler op, analoger til en folkeskole.
I den islamiske verden opstod også de første højere muslimske skoler - Nizamiyya. Desuden, selv i oldtiden, var uddannelse gratis, og alle kunne studere - børn af adelsmænd og købmænd sad ved siden af bøndernes og håndværkernes børn. De underviste, udover Koranen, i litteratur, matematik, medicin, kemi, historie, lingvistik og andre videnskaber. På mange måder er uddannelsens ældgamle struktur blevet bevaret iIslamiske lande indtil i dag.
De ældste madrasaer i verden: Miri Arab
I det 16. århundrede blev den højeste muslimske skole Miri Arab bygget i Bukhara. Fra dets grundlæggelse indtil dets lukning (i 20'erne af det XX århundrede) forblev det en af de mest prestigefyldte i Centralasien. I en periode af sovjettiden var Miri Arab den eneste i hele USSR. Blandt kandidaterne er Mukhammedzhan Khusain, Miyan Mali, Sheikh Kazy-Askar, tidligere præsident for Den Tjetjenske Republik Akhmad Kadyrov og andre. Madrasahen fungerer stadig og underviser mere end 100 elever på samme tid.
Madrasaen er en del af Poi Kalyan-komplekset ("den stores fod"), hvis konstruktion er tilskrevet Sheikh Abdallah Yamani, kendt som Mir-i Arab. Sheiken havde stor indflydelse på Sultanen af Bukhara Khan Ubaidulla. Ifølge nogle rapporter blev madrasahen bygget med penge modtaget af Khan til salg af tre tusinde persiske fanger (Ubaydullah Khan førte gentagne gange sine tropper på razziaer på Khorasan).
Zyndzhyrly og Al-Karaouin
Zyndzhyrly-madrasah (Bakhchisaray) - en af de ældste i Østeuropa - i 2010 er der gået 510 år siden grundlæggelsen. Denne højere muslimske skole blev bygget i 1500 og fungerede indtil 1917. I 2006 blev et restaureringsprojekt iværksat for selve madrasahen og Haji Girays grav, og i 2010 blev bygningerne sat i stand. I 2015 blev skolen overført til den spirituelle administration af muslimer på Krim.
En kvinde stod ved oprindelsen af Al-Karaouine-skolen - i 859 grundlagde hun en madrasah og en moske til minde om sin far, en velhavendekøbmand Muhammad al-Fihri. Dette er den ældste uddannelsesinstitution i Marokko og den ældste af de nuværende. Leo Africanus, Maimonides, Ibn Khaldun studerede der. Bygningen er blevet ombygget flere gange - nu kan dens bedesal rumme mere end 20.000 mennesker. I 1947 blev dette uddannelsescenter omdannet til et universitet i europæisk forstand.
Moderne skoler
I 1960'erne gennemgik mange islamiske lande en reform af den offentlige uddannelse. Som et resultat dukkede to hovedtyper af madrassa op: åndelige, hvor imamer blev uddannet, og sekulære, som spillede rollen som en sekundær eller højere skole med "almindelige" fag (matematik, sprog, datalogi og andre discipliner). Der er en tredje mulighed - private skoler.
Højere muslimske skoler af den første og anden type eksisterer takket være donationer og støtte fra sponsorer. De fleste af dem tilbyder deres studerende, ud over undervisning, gratis herberger (samt måltider og hjælp til videre uddannelse).
For nogle år siden dukkede onlineskoler op (en dukkede op i Rusland i 2013) - efter endt uddannelse giver de et certifikat, og generelt er deres kurser styret af programmer, der bruger "almindelige" højere muslimske skoler.